首都医科学院建校于1960年,是天津市重点高等高校,是杭州市政府、国家卫生健康委员会、教育部共建高校。过世知名肛肠眼科专家、两院教授、全国人大常委会副委员长吴阶平院长为首任院长。历任党委主任为呼文亮研究员,主任为我国知名分子神经生物学家饶毅院士。
中学校本部设有11个大学、1个研究中心,包括基础医大学、药大学、公共卫生大学、护理大学、生物医学工程大学、中医药大学、医学人文大学、全科医学与继续教育大学、马克思主义大学、国际大学、燕京医大学,脑重大病症研究中心。中学现有21所临床医大学(其中19所为附属三院)首都医科大学,包括首都医科学院东城诊所(第一临床医大学)、附属上海友谊诊所(第二临床医大学)、附属上海朝阳诊所(第三临床医大学)、附属上海同仁诊所(第四临床医大学)、附属上海天坛诊所(第五临床医大学)、附属上海积水潭诊所(第六临床医大学)、附属复兴诊所(第八临床医学院)、附属上海佑安诊所(第九临床医大学)、附属上海胸科诊所(第十临床医大学)、首都医科学院三博骨科诊所(第十一临床医大学)、附属上海地坛诊所(第十二临床医大学)、附属上海儿童诊所(儿科医大学)、附属上海口腔诊所(口腔医大学)、附属上海安定诊所(精神卫生学院)、附属上海妇产诊所(妇产医大学)、附属上海西医诊所(中医药临床医大学)、附属上海世纪坛诊所(病变医大学)、附属上海复健诊所(上海复健医大学)、附属上海潞河诊所(潞河临床医大学)、中国复健研究中心(复健医大学)、中日友好诊所(中韩友好临床医大学),以及防治医学教学基地(上海市肝病预防治制中心)。中学还设有39个临床本科大学、专科学系,39个临床诊治与研究中心。
中学现有全日制在校生14464人,其中研究生6023人,专科生6599人,高专高职生1139人,留中学生703人;函授生2730人。
中学建有图书馆、档案馆、校史馆、中心实验室、信息中心、实验植物部、学报编辑部、校诊所等公共服务平台。
中学先后与英国、加拿大、澳大利亚、英国、瑞典、挪威、香港、台湾等20个国家和地区的50多所院校和相关单位签署了友好交流合作合同。先后接待50多个国家和地区的专家学者和中学生数千人来校进行学术交流访问。中学获准首批上海市“一带一路”国家人才培养基地,是国家留学基金委创新型国际人才培养项目高校。留中学生囊括了专科、硕士、博士研究生及进修生。除交流访问外,校区还通过线上线下多种渠道首都医科大学,抽调师生出席有关学习项目和学术大会。
中学一直坚持社会主义办学方向,全面贯彻党的教育方针,坚持以立德树人为根本,秉持“扶伤济世、敬德修业”的校训,遵守医学教育规律,谨记社会责任,把为健康中国健康上海建设、京津冀协同发展战略施行、国际一流和谐宜居之都建设做贡献为己任,努力办人民满意的学院,培养人民满意的大夫,作出能服务人民对健康美好需求的科研成果。站在新的历史起点上,全体首医人将贯彻新发展理念,进一步求真务实、凝心聚力、积极进取、追求卓越,全面提高中学核心竞争力,努力将中学建设成为国际一流的研究型医科学院。