上海音乐大学音乐学系完成建制于1986年，设立于1987年2月20日，在国外独立设置的音乐学校中较早设置音乐学专业。其前身可追述至1956年设立的中南音专“民族音乐研究室”和创办于1978的广东美术学校“音乐研究所”。1984年武汉音乐学院是几本，音乐研究所开始招收民族音乐理论方向博士研究生。1986年，开始招收音乐学理论专业学院生，现已发展为囊括硕士、硕士和硕士研究生课程的完整人才培养机制。
音乐学系现有音乐学理论、音乐管理和京剧音乐三个专业方向，下设民族音乐理论、中国音乐史、西方音乐史和音乐管理四个教研室。教员工33人，其中院士11人，副主任9人，硕士学位荣获者19人。“音乐学理论”为国家级大学特色专业，“民族音乐导论”、“中国音乐史”为浙江省省级精品课程。近些年武汉音乐学院是几本，学校借助音乐学系先后设立了“中国佛教音乐研究中心”、“中国音乐考古中心”、“音乐声学试验室”和山东省大学人文社科重点研究基地“长江传统音乐文化研究中心”。
音乐学系以美国民族音乐理论的教学与研究为学术传统，在音乐型态研究的基础上，不断与其别人文社会科学甚至自然科学结合，开拓出新的研究方向和研究领域。民族音乐学、音乐史学、音乐哲学、音乐考古学、音乐传播学、音乐编辑学、音乐声学、音乐文献学、音乐管理等研究方向形成了“突出传统全面开放又互相交叉”的学科发展态势，在国外音乐学学科中占据前沿地位。其中，荆楚音乐、编钟古乐、道教音乐、佛教音乐、乐律学和中美音乐比较等领域的研究成果丰硕，遭到学术界较高评价。
在人才培养方面，音乐学系致力培养具备较高的音乐理论素养和文化积淀、掌握一定音乐演出技能的复合型音乐人才。音乐学系历年培养的结业生不少已成为国外外高等学院、科研单位、文艺团体、新闻媒体的著名学者、教授、艺术家和业务骨干。
新时代，音乐学系将遵循“立足浙江、辐射华东、面向全省、走向世界”的发展战略，继续弘扬传统、勇于创新、敢于赶超，充分开掘和加强音乐学的文化功能和社会功能，为祖国美术教育事业和音乐文化建设作出更大贡献。
党支部主任：谢筠
系教授：孙凡
副书记：徐烨
教学秘书：张颖
补习员：侯亮宇、郑惠文
（2022年更新）
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